Judith Abécassis

Après un bac scientifique, Judith hésite entre une classe préparatoire en biologie ou en mathématiques.

Elle se tourne finalement vers la biologie appréhendant le milieu très compétitif des mathématiques. Influencée par ses lectures, et par ses cours complémentaires à l’École Normale Supérieure, elle se passionne pour les applications des mathématiques et de l’informatique à la biologie.

Souhaitant avoir une formation solide et complète, elle décide de faire une 1ère année de master en biologie et consacre sa deuxième année en mathématiques appliquées. Entre, elle effectue une année de césure durant laquelle elle découvre l’apprentissage automatique. Une pause qui change tout …

Elle poursuit ses études en faisant un stage et une thèse à l’Institut Curie et à l’école des Mines.

Co-encadrée par un chercheur en apprentissage automatique et un chirurgien, elle travaille sur des algorithmes pour reconstituer l’histoire évolutive des tumeurs à partir du séquençage de leur génome. Avec ces approches, on peut retrouver les facteurs qui ont causé des mutations à différents stades d’évolution et âges de la vie.

Elle prend alors conscience du décalage entre la recherche fondamentale et la recherche à visée clinique et réalise qu’elle souhaite apporter sa pierre à l’édifice.

Judith fait deux métiers complémentaires.

D’un côté, elle crée des outils d’intelligence artificielle plus efficaces, qui donnent de meilleurs résultats sur des ordinateurs moins puissants et moins consommateurs d’énergie.

De l’autre, elle analyse d’immenses bases de données médicales avec des milliers voire des millions de dossiers de patients pour comprendre quel traitement fonctionne le mieux selon le profil de chaque patient.

Ces données ont été collectées pour soigner, pas pour faire de la recherche. Si on ne fait pas attention, on risque de tirer de fausses conclusions.
C’est pourquoi Judith travaille avec des médecins et des épidémiologistes pour poser les bonnes questions et interpréter correctement les résultats.

Une des idées clés de son travail est celle de jumeau numérique : puisqu’on ne peut pas savoir ce qui se serait passé si un patient avait reçu un traitement différent, on construit une version virtuelle de ce patient pour simuler ce scénario et comparer.

Judith partage aussi son code en open source, avec une documentation claire et pédagogique, pour que les outils soient accessibles à toutes les personnes qui travaillent sur les données.

• Judith adore les couleurs pour faire des schémas, mieux expliquer, rendre le quotidien amusant. Une habitude qu’on retrouve dans ses présentations aux titres flash, et dans le terminal qu’elle utilise pour programmer : rose.
• À côté de ses activités de recherche, Judith aime jouer avec les mots : les jeux de mots sont pour moi une façon de garder une dimension ludique dans la pratique des sciences.
• On ne peut pas anonymiser les données, même en enlevant les noms, les dates et les adresses, on peut retrouver à qui correspond un élément en le croisant avec d’autres connaissances, comme pour une enquête de police avec plusieurs témoignages et indices.
• Judith a rejoint le réseau Femmes de Tech de l’Académie des technologies pour être mentorée par des femmes expérimentées, et à son tour, motiver de jeunes profils à se tourner vers la tech.

Le portrait de Judith Abécassis a été réalisé par Solène Debiès.

Solène est une artiste et illustratrice française originaire de Brest. Elle vit et travaille entre Nantes et Paris. Elle aime les couleurs, la poésie et l’aventure.
Elle dessine pour la presse française et internationale, et collabore sur de nombreux projets de création - dont des fresques urbaines - et expose ses dessins et tableaux.

Mettre en lumière et en dessin des femmes scientifiques comme Judith l’a tout de suite motivée !